쿽익스프레스를 비롯해 기존의 출판원고 파일을 전자책으로 작업할 때  여러가지 문제가 발생한다. 세심하게 살펴서 문제를 처리해야 한다.

원고형태	파일 특성과 체크해 볼 점	난이도
Quick	가장 흔히 쓰이는 포맷 고품질의 결과물을 얻을 수 있는 뛰어난 형식 종이책 인쇄를 전제로 이루어진 구성 전자책으로 바꾸는 과정에서 까다롭다. 스타일 통일성 결여, 지나친 챕터 나눔, 한글 이름 연결 이미지파일, 선으로 그린 표, 박스처리된 각주 등이 난제	아주 높음
Indesign	최근 많이 사용된다. 독보적인 성능 전자책에 최적화하기 어렵다 스타일 기능을 적극 이용해야 한다.	높음
hwp, doc	비교적 가볍고 텍스트 위주의 원고 작업에 사용된다. 표와 각주가 많은 원고는 오히려 더 편리하다. 스타일 기능을 활용하지 않은 문서는 난이도가 상승 표라든지 각주가 많이 포함된 경우가 있기 때문에 이를 처리하는데 주의가 요망된다.	보통
xml	xml은 이미 그 구조가 최적화되어 있으므로 epub으로 변화시키기에 수월하다. 적용된 태그의 복잡성에 따라 난이도 상승	보통
txt	간단한 원고는 별 문제가 없다. 최초 원고가 복잡한 스타일을 가졌었다면 되살리기 어렵고 시간이 든다.	상~하
pdf	pdf를 epub으로 변화시키는 것은 간단한 도구로 완결되지 않는다. 변화 과정에 단락특성, 띄어쓰기, 이미지, 표, 각주 등 많은 요소에 변화가 오며 텍스트의 일부가 소실되는 경우도 있다. 이를 모두 바로 잡는 과정에 상당히 많은 시간이 소요된다. pdf를 생성한 프로그램이 무엇이냐에 따라 난이도의 차이가 있다.	아주높음